Абитуриенты получили возможность поступить на один из трёх факультетов — исторический, литературный, физико-математический. В КГПИ поступил 161 студент. С 1949 года приём осуществлялся и на заочное отделение.
Одна из ключевых проблем была нехватка кадров. К началу первого учебного года планировалось утвердить в штате института 4 доцентов, 3 старших преподавателей, ассистента и 4 заведующих кафедрами. Но полностью укомплектовать педагогический состав не получилось. На историко-филологический факультет Министерство просвещения РСФСР и вовсе не направило ни одного преподавателя. На работу принимали демобилизовавшихся из рядов вооружённых сил, почасовиков и совместителей. Аналогичное положение возникло и с техническим персоналом. В газете «Калининградская правда» регулярно публиковали объявления о поиске уборщиц, кладовщиков, грузчиков, кочегаров и других представителей рабочих профессий.
Другая сложность — нехватка книг и учебных пособий. Их обещали прислать из вузов Москвы и Ленинграда. Но к 1 сентября решить вопрос не получилось.
Не доставало топлива для обгрева помещений. Затруднительным оказался поиск квартир для прибывавших в Калининград будущих сотрудников института. А студентам и вовсе пришлось провести целую спецоперацию, чтобы заполучить общежитие.